المعهد القومى للتدريب الجمركى هو صرح تعليمى متميز يقدم خدمات دراسية متميزة للسادة العاملين بالمصلحة لتوفير المعلومات والمعرفة الجمركية اللازمة لحسن سير العمل وزيادة الوعى لديهم عن طريق توفير تدريب عملى للسادة العاملين بالمصلحة بالمواقع الجمركية المختلفة لمعرفة كيفية سير العمل على الطبيعة وطرق التهريب المختلفة والمتطورة وكيفية التعامل مع الشهادة الجمركية من لحظة دخول البضائع الدائرة الجمركية وحتى لحظة خروجها من الدائرة الجمركية وايضاً دورات متميزة فى كافة مجالات العمل الجمركى باستمرار لاطلاعهم على كل ماهو جديد ومتطور سواء المرتبطة بالعمل الجمركى او التكنولوجى
كما يوفر ايضاً دورات للسادة المستخلصين لتوعيتهم باساليب العمل الجمركى وكيفية التعامل مع الشهادات الجمركية وطرق التخليص الجمركى السليم كما ان المعهد معتمد من منظمة الجمارك العالمية وقد تم تطويره وتحديثه بالتعاون مع الجمارك السويسرية والاتحاد الاوربى
ويقوم ببناء القدرات للدول الاعضاء بمنطقة شمال افريقيا والشرق الادنى كما انه من خلال بروتوكلات التعاون مع جامعة الدول العربية قد قام بتدريب كوادر ضباط الجمارك السودانية ووصل عدد المتخرجين حتى الدفعة 25 كما قام ببناء قدرات كوادر جمركية للسلطة الفلسطينية وهناك علاقات ارتباط مع المعاهد الاقليمية المعتمدة مثل المعهد الجمركى للمملكة العربية السعودية والامارات العربية المتحدة والمملكة الاردنية .